यह सोमनाथ मंदिर भारत के 12 ज्योतिर्लिंगों में पहला ज्योतिर्लिंग माना जाता है, इस मंदिर के बारे में एक पौराणिक कथा है
पुराणों के अनुसार दक्ष प्रजापति की सत्ताईस पुत्रियाँ थीं। इन सभी का विवाह चंद्रदेव से हुआ था। लेकिन चंद्रमा का प्यार रोहिणी पर टिका रहा। यह देखकर दक्ष प्रजापति की अन्य बेटियाँ बहुत दुखी हुईं। उसने अपना दुख अपने पिता को बताया। दक्ष ने हर तरह से चंद्रमा को समझाने की कोशिश की। लेकिन चंद्रमा रोहिणी से बहुत प्यार करता था, इसलिए किसी के समझाने का उस पर कोई असर नहीं हुआ। यह देखकर दक्ष को बहुत क्रोध आया और उन्होंने चंद्रमा को क्षीण होने का श्राप दे दिया। इस श्राप के कारण चंद्रदेव क्षीण हो गए। इससे धरती पर सारे काम ठप हो गए।
हर तरफ अफरातफरी का माहौल था। चाँद बहुत उदास रहने लगा था। उनकी प्रार्थना सुनकर सभी देवता और ऋषि उनके पिता ब्रह्माजी के पास गए। पूरी बात सुनकर ब्रह्मा ने कहा कि चंद्रमा को भगवान भोलेशंकर की मृत्यु का जाप करना होगा। इसके लिए उन्हें अन्य देवताओं के साथ पवित्र प्रभास क्षेत्र में जाना होगा। चंद्रदेव ने जैसा कहा था वैसा ही किया। उन्होंने पूजा के सभी काम पूरे किए। उन्होंने घोर तपस्या की और 10 करोड़ बार मृत्युंजय मंत्र का जाप किया। इससे मृत्युंजय-भगवान शिव अत्यंत प्रसन्न हुए। शिव ने उन्हें अमरता का वरदान दिया था।
साथ ही कहा कि चंद्रदेव! तुम शोक मत करो न केवल तुम मेरे दूल्हे से अपने शाप से छुटकारा पाओगे और दक्ष के वचन भी सुरक्षित रहेंगे। हर दिन कृष्ण पक्ष के दौरान आपकी हर एक कला क्षीण होगी। लेकिन फिर, शुक्ल पक्ष में प्रत्येक कला में वृद्धि होगी। इस तरह आपको हर पूर्णिमा को पूर्णिमा मिलेगी। इससे समस्त लोकों के प्राणी प्रसन्न हुए। सुधाकर चंद्रदेव फिर से 10 दिशाओं में वर्षा की फुहारों का कार्य करने लगे। जब वह शाप से मुक्त हो गया, तो चंद्रदेव ने सभी देवताओं के साथ भगवान मृत्युंजय से प्रार्थना की। उन्होंने कहा कि उन्हें और माता पार्वती को अपने जीवन की मुक्ति के लिए हमेशा के लिए यहीं निवास करना चाहिए।
शिव ने उनकी प्रार्थना स्वीकार कर ली और ज्योतिर्लिंग के रूप में माता पार्वती के साथ यहां निवास करने लगे। पवित्र प्रभास क्षेत्र में स्थित इस सोमनाथ-ज्योतिर्लिंग की महिमा का महाभारत, श्रीमद्भागवत और स्कंदपुराणदि में विस्तार से वर्णन किया गया है। चंद्रमा को सोम भी कहा जाता है। उन्होंने शिवशंकर को अपना नाथ-स्वामी मानकर यहां तपस्या की। इसलिए इस ज्योतिर्लिंग को सोमनाथ कहा जाता है। ऐसा माना जाता है कि इस मंदिर में दर्शन करने, पूजा करने, पूजा करने से जन्म के बाद भक्तों के सभी पाप नष्ट हो जाते हैं।