चर्च में गोवा के संरक्षक संत सेंट फ्रांसिस जेवियर के पवित्र अवशेष हैं, साल 1552 में उनकी मृत्यु हो गई थी।
पुराने गोवा में सबसे प्रतिष्ठित धार्मिक संरचनाओं में से एक, बेसिलिका ऑफ बॉम जीसस पूरी दुनिया में प्रसिद्ध है। यह 400 साल पुराना है। इसके आइकॉनिक रेड लुक से कई लोग आकर्षित होते हैं, लेकिन अब बताया जा रहा है कि इस संरचना को संरक्षित करने के लिए यह चर्च अपना रेड लुक खो सकता है। बेसिलिका के एक पुजारी ने बताया कि अगर कोई इसके पत्थर को करीब से देखे तो पता चलेगा कि यह मौसम की वजह से कितना खराब हो गया है।
इसकी कारीगरी भी कई जगह खराब हुई है। कई जगह पत्थर अपने आप टूटकर चूर्ण बन गए हैं। उन्होंने आगे बताया कि पुराने गोवा के तेजी से शहरीकरण और साल भर बेमौसम बारिश जैसे कारणों से बेसिलिका की दीवारें गीली रहती हैं। लैटेराइट पत्थर इतना अधिक संतृप्त हो जाता है कि भीतरी दीवारों से भी पानी टपकने लगता है। ऐसा अतीत में कभी नहीं हुआ। बोम जीसस का अर्थ है बेबी जीसस या गुड जीसस।
शिशु यीशु को समर्पित बेसिलिका को विश्व विरासत स्मारक घोषित किया गया है। वास्तव में, इस चर्च में सेंट फ्रांसिस जेवियर के पवित्र अवशेष हैं, जो गोवा के संरक्षक संत थे। वर्ष 1552 में उनकी मृत्यु हो गई। उनके शरीर को कांच से बने एक वायुरोधी कफन में रखा गया है जिसे 17वीं शताब्दी में एक फ्लोरेंटाइम शिल्पकार जियोवानी बतिस्ता फोगिनी द्वारा चांदी के ताबूत में रखा गया था। ऐसा कहा जाता है कि गोवा लाए जाने पर संत का शरीर उतना ही ताजा था जितना कि कफन में रखते समय था।
इस चमत्कारी घटना से लोग इतने आकर्षित हुए कि उन्हें देखने के लिए देश भर से कई लोग इस चर्च में आते हैं। कहा जाता है कि संत के पास घाव भरने की चमत्कारी शक्ति थी, इसलिए दुनिया भर से लोग यहां आते हैं और प्रार्थना करते हैं। जानकारी के मुताबिक चांदी का ताबूत दिखाने के लिए लोगों को एक बार नीचे उतारा जाता है. आखिरी बार इसे साल 2004 में दिखाया गया था।